ちなみに

上で問い合わせてた内容は、

モバイルメールプラスの通知形式を「そのまま転送、アドレス変換あり」にして、携帯に転送されたメールに返信すると、Fromアドレスが別名登録した方のアドレスになってしまう
これを、@nifty ID形式のアドレスで返信できるようにする方法はあるか？
（ID宛メールを送受信可能な状態で、かつ別名登録もしている）

で、回答は、

アドレス変換機能を利用する場合、別名登録されていると、必ず別名アドレスの方で送信されてしまいます
ID形式のアドレスから送信したい場合は、PC版Webメールの「差出人設定」でID形式アドレスを登録の上、携帯版Webメールから送信して下さい
（モバイルメールの通知形式を「着信通知」にすると、通知メールに記載されたリンクからWebメールのページにジャンプできます）

と言う感じでした